Birincisi, hər iki növ su təmizləyicisi suyun çirklərini təmizləyə bilsə də, onların təmizlənməsi prinsipləri eyni deyil. RO tərs osmoslu su təmizləyicisi içəridə RO tərs osmos membranı ilə təchiz edilmişdir. Təzyiq təsiri altında su RO membranından keçə bilər, qeyri-üzvi duzlar, ağır metal ionları, bakteriya və viruslar kimi çirklər isə əks osmoz membranı tərəfindən bloklanır.

Ultrafiltrasiya su təmizləyiciləri daxili ultrafiltrasiya membranı vasitəsilə su mənbəyini təmizləyir. Təzyiq fərqinin təzyiqi altında su mənbəyi bu membran təbəqəsindən keçə və çirkləri süzə bilər.

Fərqli təmizləmə üsullarından istifadə edən iki növ su təmizləyicisi öz prinsiplərinə görə təmizləmə dəqiqliyində müəyyən fərqlərə malikdir. RO tərs osmozlu su təmizləyicisinin içərisində RO membranı var və bu membranın məsamələri nanometr səviyyəsi qədər kiçikdir. Hətta kiçik viruslar və bakteriyalar RO membranının məsamələrindən minlərlə dəfə böyükdür. Buna görə də, RO membranından keçən su, əsasən, yalnız su ehtiva edir və başqa elementlər yoxdur və süzülmüş suyu birbaşa içmək və ya qaynatmaq olar.

Ultrasüzgəcli su təmizləyicisinin içərisində ultrafiltrasiya membranı var və bu filtrləmə membranının məsamə ölçüsünün dəqiq diapazonu RO tərs osmoslu su təmizləyicisindən bir miqyas daha böyük olan 0,01 ~ 0,001μm-dir. Eyni zamanda, ultrafiltrasiya membranı təkcə suyun keçməsinə imkan vermir, həm də daha kiçik həcmli bəzi kiçik molekulyar maddələrin, məsələn, bəzi mineral elementlərin keçməsinə imkan verir.